El Sistema de Dades de DESI és el responsable de la selecció d’objectes a observar, la planificació de les observacions, la seqüència de processament de les dades, així com de la transferència, l’arxivament i la distribució dels productes generats amb les dades. La llista d’objectes a observar amb DESI es crea a partir de les dades dels cartografiats d’imatges provinent tant de diversos telescopis (Legacy Imaging surveys) com dels satèllits WISE i Gaia.
Les simulacions de les observacions ajuden a definir els algoritmes més eficaços per a la selecció dels camps del cel i l’assignació dels objectes a observar per a les operacions de DESI. L’eina Seleccionador del Següent Camp (“Next Field Selector”) utilitza aquests algoritmes en temps real per seleccionar el camp del cel òptim per a ser observat, maximitzant l’eficiència global de DESI.
Al Kitt Peak, una seqüència ràpida d’anàlisi (“quicklook”), monitoritzada pels observadors, processarà les dades en tan sols tres minuts garantir la qualitat de les observacions. Les dades, abans de ser processades, seran enviades en temps real al Centre de supercomputadors NERSC (National Energy Reserach Scientific Computing Center, en anglès) a Berkeley, Califòrnia, per fer-ne un processament detallat, l’anàlisi científica i l’arxivament. La seqüència de processament de les dades espectroscòpiques extreu els espectres dels objectes a partir de les dades en brut, en sostrau la contribució de fons del cel, en calibra el flux i finalment classifica els espectres i en mesura els desplaçaments al roig. Cada any, hi haurà aproximadament 10 Terabytes (TB) de dades brutes transferides des de l’Observatori Nacional Kitt Peak al NERSC; també existeix una còpia separada de seguretat guardada al Laboratori Nacional de Recerca d’Astronomia en l’Òptic i l’Infraroig, pertanyent a la Fundació Nacional de la Ciència (NSF OIR Lab, en anglès), a Tuscon, Arizona.
Després de processar les dades al NERSC, amb la seqüència establerta d’anàlisi (utilitzant milions de d’hores de computació en CPUs), s’hauran produït, cada any, uns 100TB en productes de dades, que es faran públics aproximament un cop l’any durant els cinc anys en que DESI estarà operatiu.