El sistema de control de instrumentos (ICS) de DESI está diseñado para realizar todas las funciones de control y monitoreo requeridas para operar DESI. Esto incluye toda la adquisición y el flujo de datos, la conexión al sistema de control del telescopio Mayall, el monitoreo de la infraestructura, el mantenimiento de una base de datos de operaciones, la orientación, la transformación de coordenadas, la coordinación del subsistema y las interfaces de usuario. En el núcleo del ICS se encuentra el sistema en línea DESI (DOS). Esto incluye un marco de aplicación para los distintos software de los subsistemas. DOS también contiene todas las interfaces de usuario, que muestran secuencias de exposición, telemetría en tiempo real y vistas previas de imágenes. El sistema de control de observación (OCS), que organiza las secuencias de exposición, controla el flujo de datos del software de un subsistema a otro utilizando una arquitectura orientada a la secuencia. DESI recopilará una gran cantidad de información de metadatos y telemetría, que se registrará en la base de datos de operaciones.
